O Departamento conta com ótima estrutura de laboratórios, em permanente modernização cujo acesso é livre para alunos discentes das quatro linhas de pesquisa, sendo usados como espaços multiusuários. Atualmente, o Departamento conta com 4 modernos laboratórios (salas 1, 18a, 18b e 122) com computadores, projetor multimídia e recursos didáticos para abrigar cursos de Métodos e Técnicas de Pesquisa em Ciência Política e Relações Internacionais, incluindo cursos oferecidos na IPSA-USP Summer School (Sala 1, Sala 122, Sala 18a e Sala 18b). Nestas salas há 80 computadores microcomputadores à disposição dos discentes utilizados no ensino de disciplinas de métodos. Os equipamentos contam com os softwares de Stata, R e Microsoft Office, além de outros softwares especializados.