O Programa de Pós-Graduação em Ciência Política orienta-se pela formação pós-graduada de alto nível e pela pesquisa inovadora em nas quatro linhas de pesquisa associadas a todas as áreas tradicionais da Ciência Política: 1) teoria política e pensamento político, 2) democracia, instituições políticas e sociedade, 3) políticas públicas e 4) relações internacionais. Ao fazê-lo estimula pesquisas interdisciplinares, dialogando com áreas afins, como o direito, a economia e a história.
Um compromisso transversal que envolve a todos diz respeito ao desenvolvimento permanente da própria Ciência Política. Assim, a pesquisa não tem em mente apenas o alcance de resultados substantivos, mas o aperfeiçoamento do próprio método de investigação - seja teórica ou empírica - capaz de elevar o patamar de qualidade da produção científica.
Algumas das Linhas de pesquisa estão nucleadas em centros específicos, associados ao DCP e dirigidos por seus professores.
São eles:
CEM - Centro de Estudos da Metrópole
CENEDIC - Centro de Estudos dos Direitos da Cidadania
NECI - Núcleo de Estudos Comparados e Internacionais
NUPRI - Núcleo de Pesquisa em Relações Internacionais
NUPPS - Núcleo de Pesquisa de Políticas Públicas.
Além destes núcleos, vários docentes e alunos mantêm vínculos com dois dos mais tradicionais centros de pesquisa independentes do País: o Centro Brasileiro de Análise e Planejamento (Cebrap) (https://cebrap.org.br/) e o Centro de Estudos de Cultura Contemporânea (Cedec) (http://www.cedec.org.br/).